2019年复旦大学875生物信息学考试大纲.docx

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新祥旭考研官网 http:/www.xxxedu.net/2019年复旦大学 875生物信息学考试大纲科目代码 875 科目名称 生物信息学一、考试内容范围生物信息学是一门综合交叉学科,是采用信息科学、计算机科学和数学等学科的观点和方法对生命的现象及其组成分子(核酸、蛋白质等)进行研究,主要研究生命中的本质和规律,包括物质组成、结构功能、生命体的能量和信息交换传递等。知识结构:生物信息学概论和数据库序列数据的收集和存储基因组序列组装和基因注释基因结构元件识别和分析双序列与多序列比对数据库检索算法序列变异研究的算法与进化分析基因表达与调控网络表观遗传学数据分析蛋白质分类与结构预测考核内容:了解生物信息学概念、研究方向和发展趋势,并熟悉重要的生物信息中心和常用数据库。了解不同类型序列数据的获取方式,掌握常用的序列存储格式及转换方式。新祥旭考研官网 http:/www.xxxedu.net/掌握常用序列联配算法,了解打分矩阵及空位罚分算法,并理解多重序列比对与进化分析的关系。理解进化分析与亲缘树的关系,掌握三种进化分析算法(最大似然法、距离法和最大简约法) 。掌握转录组分析基本方法,理解基因表达差异分析的算法。了解染色质免疫共沉淀技术,掌握 ChIP-Seq 数据处理流程和下游分析流程。掌握蛋白质结构的组成和层次,理解序列相似性与结构相似性同蛋白质分类之间的关系,掌握蛋白质结构预测方法,包括二级结构和三级结构。二、试卷结构试卷满分 150 分。序列分析算法、数据库搜索工具、进化分析原理约占 80 分左右,新一代测序数据分析、表观遗传及相关生物信息学工具和分析等约占 70 分。三、参考书目作者 书名 出版社 出版时间 版次 备注陈铭 生物信息学 科学出版社 2018 年 09 月 第三版
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