复旦大学2019年全国硕士研究生招生考试875生物信息学考试大纲.pdf

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复 旦 大 学 2 0 1 9 年 全 国 硕 士 研 究 生 招 生 考 试8 7 5 生 物 信 息 学 考 试 大 纲科 目 代 码 875 科 目 名 称 生 物 信 息 学一 、 考 试 内 容 范 围生 物 信 息 学 是 一 门 综 合 交 叉 学 科 , 是 采 用 信 息 科 学 、 计 算 机 科 学 和 数 学 等 学 科 的 观 点 和 方 法 对生 命 的 现 象 及 其 组 成 分 子 (核 酸 、 蛋 白 质 等 )进 行 研 究 , 主 要 研 究 生 命 中 的 本 质 和 规 律 , 包 括 物 质 组成 、 结 构 功 能 、 生 命 体 的 能 量 和 信 息 交 换 传 递 等 。知 识 结 构 : 生 物 信 息 学 概 论 和 数 据 库 序 列 数 据 的 收 集 和 存 储 基 因 组 序 列 组 装 和 基 因 注 释 基 因 结 构 元 件 识 别 和 分 析 双 序 列 与 多 序 列 比 对 数 据 库 检 索 算 法 序 列 变 异 研 究 的 算 法 与 进 化 分 析 基 因 表 达 与 调 控 网 络 表 观 遗 传 学 数 据 分 析 蛋 白 质 分 类 与 结 构 预 测考 核 内 容 :了 解 生 物 信 息 学 概 念 、 研 究 方 向 和 发 展 趋 势 , 并 熟 悉 重 要 的 生 物 信 息 中 心 和 常 用 数 据 库 。了 解 不 同 类 型 序 列 数 据 的 获 取 方 式 , 掌 握 常 用 的 序 列 存 储 格 式 及 转 换 方 式 。掌 握 常 用 序 列 联 配 算 法 , 了 解 打 分 矩 阵 及 空 位 罚 分 算 法 , 并 理 解 多 重 序 列 比 对 与 进 化 分 析的 关 系 。 理 解 进 化 分 析 与 亲 缘 树 的 关 系 , 掌 握 三 种 进 化 分 析 算 法 (最 大 似 然 法 、 距 离 法 和 最 大 简 约法 )。 掌 握 转 录 组 分 析 基 本 方 法 , 理 解 基 因 表 达 差 异 分 析 的 算 法 。了 解 染 色 质 免 疫 共 沉 淀 技 术 , 掌 握 ChIP-Seq数 据 处 理 流 程 和 下 游 分 析 流 程 。掌 握 蛋 白 质 结 构 的 组 成 和 层 次 , 理 解 序 列 相 似 性 与 结 构 相 似 性 同 蛋 白 质 分 类 之 间 的 关 系 ,掌 握 蛋 白 质 结 构 预 测 方 法 , 包 括 二 级 结 构 和 三 级 结 构 。二 、 试 卷 结 构试 卷 满 分 150 分 。 序 列 分 析 算 法 、 数 据 库 搜 索 工 具 、 进 化 分 析 原 理 约 占 80 分 左 右 , 新一 代 测 序 数 据 分 析 、 表 观 遗 传 及 相 关 生 物 信 息 学 工 具 和 分 析 等 约 占 70 分 。三 、 参 考 书 目作 者 书 名 出 版 社 出 版 时 间 版 次 备 注陈 铭 生 物 信 息 学 科 学 出 版 社 2018 年 09 月 第 三 版
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