南京邮电大学考研专业课考试大纲826生物信息学.doc

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生物信息学考试大纲一、 基本要求 掌握生物信息学常用数据库和使用方法;掌握序列比对方法和主要比对软件使用方法;掌握 DNA 序列和蛋白质序列特征分析和常用序列分析软件包使用方法;掌握分子进化理论和常用分析方法;掌握基因功能注释方法和常用软件使用方法;掌握基因表达数据分析方法和常用分析软件使用方法。二、 考试范围 1. 课程相关知识基本要求:掌握生物信息学的定义、基本概念和发展;掌握生物信息学研究的基本内容、基本原理和生物学基础;了解计算机在生物研究中的应用;了解生物信息学发展史、开发与产业化。1生物信息学数据库 (1)知识点 1:NCBI 数据库的介绍 (2)知识点 2:Swiss-Prot 数据库 (3)知识点 3:PDB 数据库 基本要求: 掌握 NCBI 数据库的建设和使用方法;掌握 Swiss-Prot 和 PDB 数据库的使用方法。 2.序列比对(1)知识点 1:双重序列比对分析 (2)知识点 2:多序列比对分析 (3)知识点 3:BLAST 数据库搜索 基本要求:掌握序列比对的原理和方法;掌握如何使用 BLAST 软件进行数据库搜索和同源性分析。3.序列特征分析(1)知识点 1:DNA 序列特征分析(2)知识点 2:蛋白质序列特征分析 基本要求:掌握基因预测的原理和方法;掌握启动子区域预测和分析的原理和方法;掌握蛋白质序列跨膜区分析的原理和方法。4.分子进化分析 (1)知识点 1:系统发育树的概念 (2)知识点 2:分子进化理论 (3)知识点 3:系统发育树的构建基本要求:掌握系统发育树的概念;掌握 DNA 和蛋白质序列适应性进化的分子理论;掌握系统发育树构建的原理和方法。 5. 基因功能注释(1)知识点 1:基因功能的基本概念(2)知识点 2:基因功能的注释原理和方法基本要求:掌握基因注释和功能分类的基本概念;掌握基因功能注释的原理和方法;掌握常用基因功能注释软件的使用;6.基因表达数据分析 (1)知识点 1:基因表达数据获取的生物学技术平台 (2)知识点 2:基因表达数据分析 基本要求:掌握基因表达技术的主要生物学平台;掌握基因表达数据的主要分析方法和原理;掌握基因表达数据分析常用软件的使用。
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